Desde el año 2000 e ininterrumpidamente (incluso con varios medallistas en los que sobresalen tres medallas de oro nacionales), el Colegio Confluencia le dio un fuerte impulso a la participación de sus alumnos de Nivel Secundario en el programa Olimpiadas Argentina de Química, ya que considera que es una excelente instancia de aprendizaje y descubrimiento de talentos. O. A. Q. es promovido y organizado por la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires. Se trata de una actividad extracurricular y su entrenamiento específico se realiza en el “Taller de Química”, del que actualmente participan los alumnos de 2º y 4º Año. Los certámenes de la competencia constan de cuatro instancias: Colegial, Intercolegial, Zonal y Nacional, aumentando en cada uno la complejidad y cantidad de contenidos de la asignatura.